Hola ! A ver por partes, los cuidados de la agama son muy parecidos a los de la pogona, así que intentaremos ayudar..
El punto maximo de calor para mí debería estar en 40 grados, un poquito más alto..
Por lo de las "escamas" no te preocupes, es totalmente normal, entiendo que esta mudando.

Me intriga lo de la bombilla de infrarrojos ( es de color rojo? ) que incluye uva.. Explicanos bien lo de la iluminación, cómo está montado.
Que tipo de suplementos le das.. calcio, vitaminas y cómo..
Cómo son las heces? Cada cuanto defeca?

Es muy poco probable que tu agama sea nacida en cautividad, por lo que siempre es preferible visitar al veterinario, por el tema de parásitos, es bastante habitual y quizá cuadra con la sintomatología..